Windowsで使っていたHDDがいつも使っている"gnome-disk-utility"で初期化できなかったのでメモ。
使用OSは、"Ubuntu 16.04.3"です。

使用ツール

結論から言うと、Buffaloの"DiskFormatter2"を使用しました。
"DiskFormatter2"は、Windowsで利用できるディスクフォーマッタです。

フォーマッタとは

base on フォーマッタ

フォーマッタとは、ハードディスクなどの記憶装置を初期化（フォーマット）するためのソフトウェアのことである。

使ったツール

• DiskFormatter2
  • Disk Formatter2 Ver.1.24（2017年5月10日掲載）
    対応OS ：
    Windows 10 (64ビット/32ビット),
    Windows 8.1 (64ビット/32ビット),
    Windows 8 (64ビット/32ビット),
    Windows 7 (64ビット/32ビット),
    Windows Vista (64ビット/32ビット),
    Windows XP

なお、Buffalo以外のパソコン周辺機器メーカーからも提供されています。

• Logitec ディスクフォーマッタ
• I-O DATA ハードディスクフォーマッタ
  など

留意事項

DiskFormatter2は説明によると、「BUFFALO製 USB HDD/SSD/USBメモリに対応」と記載されています。
別製品でも使えますが、使用に際しては「ダウンロードソフトウェア使用許諾について」をご一読ください

ディスクフォーマッタとgnome-disk-utilityのセットで

ディスクフォーマッタで初期化したディスクを再度Windowsの"コンピュータの管理"-"ディスクの管理"でチェックすると、初期化されていることが確認できました。
ただ、なぜか再設定ができなかったので、最後はいつもどおりgnome-disk-utilityでもう一度初期化しました。
その後は問題なく使用できています。